Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vipas39Q8BGQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms