Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubash3bQ8BGG7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubash3bQ8BGG7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms