Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4bQ8BGE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg4bQ8BGE6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms