Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd4Q8BFT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd4Q8BFT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms