Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M10.3Q85ZW6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms