Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChfrQ810L3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms