Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pkhd1l1Q80ZA4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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