Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NanogQ80Z64 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NanogQ80Z64 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms