Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AknaQ80VW7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AknaQ80VW7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AknaQ80VW7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms