Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf4Q80VU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf4Q80VU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms