Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrrc1Q80VQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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