Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Avl9Q80U56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms