Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NischQ80TM9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NischQ80TM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
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