Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClmQ7TSN2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmQ7TSN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms