Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctdp1Q7TSG2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctdp1Q7TSG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms