Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Dsg1cQ7TSF0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dsg1cQ7TSF0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms