Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mycbp2Q7TPH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mycbp2Q7TPH6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms