Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shq1Q7TMX5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shq1Q7TMX5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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