Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwistnbQ78WZ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms