Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim12Q78RX3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms