Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Higd1cQ76I25 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Higd1cQ76I25 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms