Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SynmQ70IV5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SynmQ70IV5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms