Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnih3Q6ZWS4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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