Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LcorQ6ZPI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorQ6ZPI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms