Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl3Q6W5C0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms