Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2eQ6VUP9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfap2eQ6VUP9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms