Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc9c1Q6UJY2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc9c1Q6UJY2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms