Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms