Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a7Q6PGE7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a7Q6PGE7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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