Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc82Q6PG04 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms