Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfrlQ6PE55 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms