Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc85bQ6PDY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc85bQ6PDY0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms