Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms