Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dtx4Q6PDK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dtx4Q6PDK8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms