Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms