Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb40Q6PCS8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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