Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gapvd1Q6PAR5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gapvd1Q6PAR5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms