Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc148Q6P5U8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms