Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fam222bQ6P539 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms