Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frg2f1Q6P3A2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms