Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms