Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Soga3Q6NZL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Soga3Q6NZL0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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