Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Szrd1Q6NXN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms