Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gpbp1Q6NXH3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpbp1Q6NXH3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms