Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23aQ6NVH0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23aQ6NVH0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23aQ6NVH0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23aQ6NVH0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms