Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo41Q6NS60 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fbxo41Q6NS60 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms