Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc66Q6NS45 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms