Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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CltbQ6IRU5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms