Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arhgap20Q6IFT4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arhgap20Q6IFT4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms