Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms